Yo empecé mi andadura en este foro con la misma duda, Mazda o Skoda, y ya me ves.
Si es verdad, que son motores completamente diferentes, porque imagino que estas entre el 2.5 192 y el 2.0 220 no?
Te doy mi opinión y por lo que finalmente mi balanza se decantó hacia Mazda:
-Motor más fiable. (aunque menos potente)
-Mas exclusivo, (skoda RS, he visto unos 10, desde que me compre el mazda, como el mio 4)
-Acabados de mayor calidad (quitando los asientos, ya que el RS trae un baquets tremendos, el resto de acabados son bastante generalistas)
-Más confort (las suspensiones son más blandas, habrá quien prefiera el RS, pero yo lo encontré un poco demasiado duro)
-Más silencioso (si un defecto tiene los 2.0 TFSI, es que a relantí suenan como un diesel, lo odio)
-Mejor estética ( para mi el M6 tiene un línea más deportiva y elegante, el RS es muy bonito, pero porque los paragolpes y escapes especificos hacen mucho, si le quitas eso...)
-mejor cambio (a mi parecer el cambio del mazda, es mejor que los Stronic, por su suavidad, vengo de un Q5, y si es un pelin más rapido, pero para aparcar tienes que ir con tacto de seda o acabas tocando...)
Como digo es mi opinión y en mi caso las razones por las que me decanté por el mazda.